建筑工程系创建于1984年，同年工业与民用建筑工程专业首届招收本科，学制四年。现有3个专业（土木工程专业、城市规划专业、给水与排水工程专业）、3个专业方向[土木工程专业（建筑工程方向）（交通土建工程方向）、(工程管理方向)]。1985年增招环境保护专业专科学生。1987年增设给排水专业并于同年招收专科学生。1994年增设采暖通风与空调工程专业，同年开始招收专科学生。1999年增设城市规划专业，2000年增设土木工程专业 (交通土建方向)，2001年招收给排水专业，2003年增设土木工程专业(工程管理)方向本科学生。
建筑工程系现有力学、给排水、建筑、结构、城规、道桥、工程管理等七个教研室，并有土力学、建筑材料、材料力学、给排水、城规五个实验室，其中高原建筑材料实验室被确定为省级重点实验室。系里还设有建筑设计所、工程监理公司和青海大学高原工程试验测试中心等教学、设计、施工、监理、科研一体化的相关机构。
建筑工程系现有教职工47人，高级职称教师18人，高级职称比例占38%，其中专任教师40人，其中包括：在读博士2人、研究生12人。教辅人员2人，实验人员5人。
从1984年至今建筑工程系共培养工业与民用建筑、建筑工程、给水排水工程、采暖通风与空调工程、环境保护、城市规划、道路与桥梁等专业毕业生1200余人。另外，还培养了工民建专业自学考试毕业生280余人。历届毕业生获学士学位共584人。1999年毕业生一次就业率为100%，2000年为97.4%，2001年为77.4%，2002年为92%，2003年为90%，2004年为91%。
全系现有16个教学班，共 613名学生。
建工系是青海省唯一培养土木工程专业（建筑工程方向、交通土建方向和工程管理方向）、给水与排水工程专业、城市规划专业的本科高级技术人才的系科。培养的高级专业人才直接面向全国经济建设主战场，我们的教学宗旨是使学生成为“会设计、能施工、懂管理”的高级专业技术人才，即培养土木工程、给水与排水工程和城市规划学科的学生具有工程师、规划师和企业家素质的高级专门技术和管理的应用型人才。服务面向为：立足建筑、规划行业，面向社会，努力为西部大开发和全国经济建设服务。
建筑工程系注重教学改革，正努力培养实用型、复合型人才。为了适应经济的发展和社会的需要，在专业调整、教学内容及方法、学风建设、科研管理等方面进行了深化改革，正以新的面貌为国家的现代化建设培养和输送各类高级专业人才。目前承担科研项目共8项，其中国家“863”计划项目2项，省部级项目6项。全系近3年共发表研究论文180余篇。
